色彩在卧室装修设计时，起着非常重要的作用。而硅藻泥颜色的搭配也是非常地讲究。
比如同色系搭配——一种色彩多种色调搭配，从上到下，由浅入深。
相似色搭配，相邻或近似色彩如红色和橙色，绿色和青绿色，粉红色和淡紫色，并且色调一致，最多不超过三种可四种。
互补色搭配——互补色如蓝色和橙色，绿色和红色，紫色和黄色，这样的房间抢眼而且会给人印象深刻，但更能显现硅藻泥颜色特点。
色彩对人的情绪有着明显的影响。人在家中的时间占去一天中的10个小时以上，因此科学的色彩搭配，能使人在家中获得快乐的情绪。
首先，根据城市气候来选择色彩
气候比较潮湿的热带、亚热带地区，可选用一些偏冷的硅藻泥色调，如：浅褐、浅紫、浅绿、蓝色，如此能营造出宁静、凉爽、恬适的家居风格，让业主身心舒畅。
根据不同功能空间选择色彩
在客厅中加入淡淡的玫瑰红、浅紫色和蓝色装饰，能使人感觉温暖而放松。在就餐的环境中，墙壁以棕色、棕黄、肉色为主，能促进食欲，令人精神焕发；但是，灰色、芥茉黄色、紫色和青绿色，从色彩心理学上分析，可能会使人减小食欲，甚至倒胃口；如果餐厅中多以蓝色、绿色为主，也可能使人减少进食，但并不会影响胃口。
在卧室中多用一些浅绿、浅桃红色的装饰，会让人感觉身在春天，温暖、明媚，尤其适用于气候较寒冷地区的房屋。如果在卧室中多用浅蓝色，虽不能令人感觉暖和，但可以促使人镇静，保持身心舒畅。
在卫生间中使用鲜亮的米白色、浅黄色、粉红色和肉色，可以使人感觉放松；如果在卫生间中使用太多绿色装饰，可能使墙上反射的光线影响到人的脸色，令你从镜子中看到自己“面如菜色”，从而影响心情。
在书房中多使用棕色、金色、木色的装饰，能使人感觉温和、安宁、舒适、精神放松，从而更好地在家中进行思考和创作。
根据朝向选择色彩
朝东的房间由于最早晒到日光也最早离开而使房间较早变暗，所以使用浅暖色如红色、橙色、黄色系列及和谐自然图案藻伦、松纹往往最适宜。
朝南的房间日照时间最长，使用冷色如绿色、蓝色系列及简单时尚纹理如断丝特别是朝窗的墙面用松纹、横竖锯纹等纹理，随阳光的照射变化质感更强，更舒适，房间效果也更迷人。
朝西的房间由于受到一天中最强烈的落日西照的影响使用深冷色如蓝色、青色系列及断丝简单图案更好。
朝北的房间由于没有日光的照射，使用浅暖色及藻伦、弹涂等图案。
根据家庭人口数选择色彩
对于老年人或体弱者，以及家庭人口较少，略显萧条寂寞的卧室，适宜采用暖色硅藻泥，以便提升家居温暖祥和的气息。面对家庭人口比较多，较为喧闹的家居氛围，卧室则偏向于选择冷色硅藻泥装修墙面。